„Мы молились о скором строительстве польских военных кладбищ. Сколько усилий пришлось приложить и невзгод преодолеть за эти десять лет, знают только те, кого мы сегодня можем поблагодарить от всего сердца.”
Доктор Рышард Рудзиньский, из речи, произнесённой 28 июля 2000 года во время церемонии открытия Польского военного кладбища в Катыни
Вместе с публикацией 13 апреля 1990 года агентством ТАСС заявления властей Советского Союза, содержащим выводы «о непосредственной ответственности за злодеяния в катынском лесу Берии, Меркулова и их подручных», появился шанс на надлежащее и достойное увековечивание памяти жертв этой трагедии. Семьи и родственники убитых, объединенные в Федерации катынских семей, приняли решение о строительстве польского военного кладбища в Катыни. Это желание повлекло за собой, как оказалось, длинные и трудные переговоры между властями Республики Польша и правительством Российской Федерации.
Строительству кладбища предшествовали контрольно-измерительные работы, проведённые польскими экспертами, геодезические и картографические исследования, а также эксгумация останков жертв. Все работы были организовал и координировал Совет охраны памяти борьбы и мученичества (ROPWiM) во главе с Анджеем Пшевозьником. Несомненно, контрольные и эксгумационные работы, проведенные в Катынском лесу в 1994-1995 годах специалистами под руководством профессора Мариана Глосека, доказали, что в массовых захоронениях находятся останки польских солдат, убитых НКВД весной 1940 года. Точные геодезические измерения территории позволили подготовить необходимую документацию для проведения конкурса на проект освоения территории кладбища в Катыни.
После многолетних усилий и дипломатических стараний 25 марта 1995 года в Смоленске был подписан документ о строительстве польского кладбища в Катыни. В июне 1995 года, в пятьдесят пятую годовщину Катынского преступления, президент Республики Польша Лех Валенса заложил учредительный акт и первый камень, освященный Папой Римским Иоанном Павлом II для строительства польского военного кладбища в Катыни.
В открытом конкурсе Совета охраны памяти борьбы и мученичества (ROPWiM) на проект застройки кладбищ в Катыни, Медном и Харькове победила команда под руководством двух специалистов: скульптора Здзислава Пидека из Государственной высшей школы изобразительных искусств в Гданьске и Анджея Солыги из Академии изящных искусств в Варшаве.
В 1998-1999 годах по результатам тендера были отобраны подрядчики для строительства кладбища. Земляные и строительные работы выполнялись польскими компаниями — AO Budimex вместе с субподрядчиком OOO Energotechnika из Кнурова. Консорциум АО Budimex и АО Metalodlew из Кракова позаботился о производстве скульптурных элементов кладбища, их доставке и установке. Колокол был изготовлен литейным заводом Януша Фельчиньского из Пшемысля.
В апреле 1999 Совет охраны памяти борьбы и мученичества получил от российских властей разрешение на строительство кладбища и право распоряжаться землей с этой целью. Месяц спустя начались строительные работы. 28 июля 2000 года в рамках 60-летия Катынского преступления состоялось торжественное открытие и освящение Польского военного кладбища в Катыни. И эта церемония, и само строительство проходили под патронатом председателя Совета Министров РП, профессора Ежи Бузека.